Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms