Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTLA4P16410 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms