Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC130P13994 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms