Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRG2P13727 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG2P13727 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms