Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFTRP13569 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFTRP13569 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFTRP13569 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFTRP13569 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFTRP13569 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFTRP13569 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFTRP13569 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFTRP13569 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFTRP13569 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFTRP13569 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFTRP13569 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFTRP13569 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CFTRP13569 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFTRP13569 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFTRP13569 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFTRP13569 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFTRP13569 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CFTRP13569 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFTRP13569 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFTRP13569 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFTRP13569 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFTRP13569 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CFTRP13569 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFTRP13569 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFTRP13569 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFTRP13569 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFTRP13569 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CFTRP13569 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFTRP13569 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFTRP13569 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFTRP13569 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CFTRP13569 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFTRP13569 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFTRP13569 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFTRP13569 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFTRP13569 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFTRP13569 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFTRP13569 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFTRP13569 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFTRP13569 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFTRP13569 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFTRP13569 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFTRP13569 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFTRP13569 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFTRP13569 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CFTRP13569 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFTRP13569 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFTRP13569 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFTRP13569 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFTRP13569 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFTRP13569 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFTRP13569 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFTRP13569 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFTRP13569 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFTRP13569 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFTRP13569 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CFTRP13569 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CFTRP13569 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFTRP13569 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFTRP13569 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFTRP13569 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFTRP13569 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFTRP13569 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CFTRP13569 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CFTRP13569 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFTRP13569 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFTRP13569 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFTRP13569 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFTRP13569 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFTRP13569 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFTRP13569 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFTRP13569 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFTRP13569 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFTRP13569 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CFTRP13569 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFTRP13569 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFTRP13569 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFTRP13569 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFTRP13569 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFTRP13569 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFTRP13569 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms