Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEFHP12036 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEFHP12036 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEFHP12036 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEFHP12036 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEFHP12036 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEFHP12036 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEFHP12036 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEFHP12036 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEFHP12036 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEFHP12036 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEFHP12036 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEFHP12036 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEFHP12036 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms