Protein–RNA interactions for Protein: P11274

BCR, Breakpoint cluster region protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP11274 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCRP11274 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCRP11274 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCRP11274 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BCRP11274 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCRP11274 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCRP11274 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCRP11274 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BCRP11274 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCRP11274 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCRP11274 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCRP11274 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCRP11274 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCRP11274 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCRP11274 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCRP11274 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCRP11274 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BCRP11274 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCRP11274 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCRP11274 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCRP11274 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCRP11274 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCRP11274 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BCRP11274 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCRP11274 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BCRP11274 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BCRP11274 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BCRP11274 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BCRP11274 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BCRP11274 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCRP11274 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCRP11274 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCRP11274 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCRP11274 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCRP11274 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCRP11274 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCRP11274 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCRP11274 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCRP11274 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCRP11274 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCRP11274 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCRP11274 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCRP11274 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCRP11274 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCRP11274 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms