Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMC1P11047 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMC1P11047 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMC1P11047 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
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