Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGHV1-8P0DP01 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms