Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms