Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C4AP0C0L4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C4AP0C0L4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms