Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM2P07951 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM2P07951 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM2P07951 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPM2P07951 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms