Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4P02776 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4P02776 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4P02776 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PF4P02776 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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