Protein–RNA interactions for Protein: P02760

AMBP, Protein AMBP, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBPP02760 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMBPP02760 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMBPP02760 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMBPP02760 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBPP02760 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBPP02760 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBPP02760 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBPP02760 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBPP02760 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBPP02760 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBPP02760 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBPP02760 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBPP02760 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBPP02760 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBPP02760 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBPP02760 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMBPP02760 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms