Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGAP02671 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGAP02671 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGAP02671 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGAP02671 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGAP02671 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGAP02671 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGAP02671 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGAP02671 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGAP02671 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGAP02671 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FGAP02671 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGAP02671 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FGAP02671 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FGAP02671 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FGAP02671 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FGAP02671 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGAP02671 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGAP02671 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGAP02671 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FGAP02671 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGAP02671 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGAP02671 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGAP02671 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FGAP02671 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGAP02671 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FGAP02671 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGAP02671 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGAP02671 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGAP02671 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGAP02671 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGAP02671 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGAP02671 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGAP02671 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGAP02671 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGAP02671 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGAP02671 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms