Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTA1P02549 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms