Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV12-3P01733 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV12-3P01733 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms