Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP19O94966 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP19O94966 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP19O94966 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP19O94966 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP19O94966 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP19O94966 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP19O94966 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP19O94966 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP19O94966 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP19O94966 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP19O94966 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP19O94966 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP19O94966 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP19O94966 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP19O94966 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP19O94966 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP19O94966 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP19O94966 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP19O94966 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP19O94966 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP19O94966 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP19O94966 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP19O94966 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP19O94966 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP19O94966 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP19O94966 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP19O94966 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP19O94966 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP19O94966 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP19O94966 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP19O94966 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP19O94966 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP19O94966 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP19O94966 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP19O94966 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP19O94966 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP19O94966 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP19O94966 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP19O94966 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP19O94966 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP19O94966 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP19O94966 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP19O94966 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP19O94966 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP19O94966 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP19O94966 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP19O94966 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP19O94966 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP19O94966 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP19O94966 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP19O94966 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP19O94966 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP19O94966 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP19O94966 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP19O94966 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP19O94966 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP19O94966 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP19O94966 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP19O94966 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP19O94966 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP19O94966 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP19O94966 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP19O94966 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP19O94966 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP19O94966 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP19O94966 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP19O94966 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms