Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG12O94817 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG12O94817 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATG12O94817 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG12O94817 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG12O94817 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG12O94817 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms