Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKAP2O75563 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKAP2O75563 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms