Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGR5O75473 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGR5O75473 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGR5O75473 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGR5O75473 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGR5O75473 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGR5O75473 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms