Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CXCL13O43927 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL13O43927 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms