Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SYNGR3O43761 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGR3O43761 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms