Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms