Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD6O43541 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms