Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD3O43242 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD3O43242 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD3O43242 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD3O43242 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD3O43242 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD3O43242 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD3O43242 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMD3O43242 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PSMD3O43242 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMD3O43242 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms