Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD9O15198 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD9O15198 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms