Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCER2I3L3R5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms