Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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