Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms