Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPIPA5E9PKD4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms