Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms