Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms