Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VGLL3A8MV65 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VGLL3A8MV65 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms