Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM4A7MD48 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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