Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NCBP2LA6PVI3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms