Protein–RNA interactions for Protein: A6NKQ9

CGB1, Choriogonadotropin subunit beta variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB1A6NKQ9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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CGB1A6NKQ9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CGB1A6NKQ9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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CGB1A6NKQ9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CGB1A6NKQ9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CGB1A6NKQ9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CGB1A6NKQ9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CGB1A6NKQ9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CGB1A6NKQ9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB1A6NKQ9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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