Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HELTA6NFD8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms