Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL33A6NCF5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms