Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR11A4FU01 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTMR11A4FU01 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms