Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms