Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NR2E3Q9Y5X4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NR2E3Q9Y5X4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NR2E3Q9Y5X4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NR2E3Q9Y5X4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NR2E3Q9Y5X4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NR2E3Q9Y5X4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NR2E3Q9Y5X4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NR2E3Q9Y5X4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NR2E3Q9Y5X4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NR2E3Q9Y5X4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NR2E3Q9Y5X4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NR2E3Q9Y5X4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NR2E3Q9Y5X4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NR2E3Q9Y5X4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NR2E3Q9Y5X4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NR2E3Q9Y5X4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NR2E3Q9Y5X4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NR2E3Q9Y5X4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NR2E3Q9Y5X4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NR2E3Q9Y5X4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NR2E3Q9Y5X4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NR2E3Q9Y5X4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NR2E3Q9Y5X4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NR2E3Q9Y5X4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NR2E3Q9Y5X4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NR2E3Q9Y5X4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NR2E3Q9Y5X4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NR2E3Q9Y5X4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NR2E3Q9Y5X4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NR2E3Q9Y5X4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NR2E3Q9Y5X4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NR2E3Q9Y5X4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NR2E3Q9Y5X4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NR2E3Q9Y5X4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NR2E3Q9Y5X4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NR2E3Q9Y5X4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NR2E3Q9Y5X4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NR2E3Q9Y5X4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NR2E3Q9Y5X4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NR2E3Q9Y5X4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NR2E3Q9Y5X4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NR2E3Q9Y5X4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NR2E3Q9Y5X4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms