Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3D2

MSRB2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2Q9Y3D2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSRB2Q9Y3D2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSRB2Q9Y3D2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MSRB2Q9Y3D2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSRB2Q9Y3D2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSRB2Q9Y3D2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSRB2Q9Y3D2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSRB2Q9Y3D2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSRB2Q9Y3D2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSRB2Q9Y3D2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSRB2Q9Y3D2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSRB2Q9Y3D2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSRB2Q9Y3D2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MSRB2Q9Y3D2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSRB2Q9Y3D2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSRB2Q9Y3D2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MSRB2Q9Y3D2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSRB2Q9Y3D2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MSRB2Q9Y3D2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSRB2Q9Y3D2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSRB2Q9Y3D2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSRB2Q9Y3D2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRB2Q9Y3D2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSRB2Q9Y3D2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSRB2Q9Y3D2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSRB2Q9Y3D2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSRB2Q9Y3D2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MSRB2Q9Y3D2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSRB2Q9Y3D2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSRB2Q9Y3D2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSRB2Q9Y3D2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRB2Q9Y3D2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRB2Q9Y3D2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRB2Q9Y3D2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRB2Q9Y3D2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSRB2Q9Y3D2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSRB2Q9Y3D2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRB2Q9Y3D2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRB2Q9Y3D2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRB2Q9Y3D2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRB2Q9Y3D2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSRB2Q9Y3D2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRB2Q9Y3D2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRB2Q9Y3D2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRB2Q9Y3D2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRB2Q9Y3D2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSRB2Q9Y3D2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSRB2Q9Y3D2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSRB2Q9Y3D2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSRB2Q9Y3D2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSRB2Q9Y3D2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSRB2Q9Y3D2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms