Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRQQ9UMZ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRQQ9UMZ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRQQ9UMZ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRQQ9UMZ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms