Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
ZNF608Q9ULD9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
ZNF608Q9ULD9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ZNF608Q9ULD9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
ZNF608Q9ULD9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
ZNF608Q9ULD9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
ZNF608Q9ULD9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC44.38■■■■■ 4.69
ZNF608Q9ULD9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
ZNF608Q9ULD9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
ZNF608Q9ULD9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
ZNF608Q9ULD9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC44.35■■■■■ 4.69
ZNF608Q9ULD9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
ZNF608Q9ULD9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ZNF608Q9ULD9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
ZNF608Q9ULD9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
ZNF608Q9ULD9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
ZNF608Q9ULD9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
ZNF608Q9ULD9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
ZNF608Q9ULD9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
ZNF608Q9ULD9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
ZNF608Q9ULD9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC44.29■■■■■ 4.68
ZNF608Q9ULD9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
ZNF608Q9ULD9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
ZNF608Q9ULD9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
ZNF608Q9ULD9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
ZNF608Q9ULD9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
ZNF608Q9ULD9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
ZNF608Q9ULD9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
ZNF608Q9ULD9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ZNF608Q9ULD9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
ZNF608Q9ULD9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
ZNF608Q9ULD9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.67
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
ZNF608Q9ULD9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.66
ZNF608Q9ULD9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
ZNF608Q9ULD9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
ZNF608Q9ULD9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
ZNF608Q9ULD9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.17■■■■■ 4.66
ZNF608Q9ULD9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
ZNF608Q9ULD9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
ZNF608Q9ULD9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
ZNF608Q9ULD9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
ZNF608Q9ULD9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
ZNF608Q9ULD9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
ZNF608Q9ULD9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
ZNF608Q9ULD9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
ZNF608Q9ULD9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC44.12■■■■■ 4.65
ZNF608Q9ULD9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
ZNF608Q9ULD9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
ZNF608Q9ULD9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
ZNF608Q9ULD9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
ZNF608Q9ULD9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
ZNF608Q9ULD9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
ZNF608Q9ULD9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
ZNF608Q9ULD9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
ZNF608Q9ULD9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
ZNF608Q9ULD9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
ZNF608Q9ULD9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
ZNF608Q9ULD9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
ZNF608Q9ULD9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
ZNF608Q9ULD9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
ZNF608Q9ULD9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ZNF608Q9ULD9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
ZNF608Q9ULD9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
ZNF608Q9ULD9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
ZNF608Q9ULD9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
ZNF608Q9ULD9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
ZNF608Q9ULD9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
ZNF608Q9ULD9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
ZNF608Q9ULD9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
ZNF608Q9ULD9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
ZNF608Q9ULD9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
ZNF608Q9ULD9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.63
ZNF608Q9ULD9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
ZNF608Q9ULD9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.63
ZNF608Q9ULD9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ZNF608Q9ULD9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
ZNF608Q9ULD9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
ZNF608Q9ULD9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
ZNF608Q9ULD9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
ZNF608Q9ULD9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
ZNF608Q9ULD9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
ZNF608Q9ULD9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.88■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC43.86■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
ZNF608Q9ULD9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms