Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CROTQ9UKG9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CROTQ9UKG9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CROTQ9UKG9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CROTQ9UKG9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CROTQ9UKG9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms