Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
USP21Q9UK80 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
USP21Q9UK80 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
USP21Q9UK80 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
USP21Q9UK80 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
USP21Q9UK80 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP21Q9UK80 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP21Q9UK80 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
USP21Q9UK80 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
USP21Q9UK80 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
USP21Q9UK80 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
USP21Q9UK80 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
USP21Q9UK80 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
USP21Q9UK80 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
USP21Q9UK80 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
USP21Q9UK80 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
USP21Q9UK80 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
USP21Q9UK80 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
USP21Q9UK80 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
USP21Q9UK80 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
USP21Q9UK80 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
USP21Q9UK80 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
USP21Q9UK80 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
USP21Q9UK80 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
USP21Q9UK80 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
USP21Q9UK80 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
USP21Q9UK80 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
USP21Q9UK80 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
USP21Q9UK80 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
USP21Q9UK80 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
USP21Q9UK80 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
USP21Q9UK80 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
USP21Q9UK80 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
USP21Q9UK80 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
USP21Q9UK80 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
USP21Q9UK80 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
USP21Q9UK80 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
USP21Q9UK80 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
USP21Q9UK80 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
USP21Q9UK80 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
USP21Q9UK80 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
USP21Q9UK80 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
USP21Q9UK80 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
USP21Q9UK80 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
USP21Q9UK80 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
USP21Q9UK80 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
USP21Q9UK80 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
USP21Q9UK80 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
USP21Q9UK80 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
USP21Q9UK80 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
USP21Q9UK80 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
USP21Q9UK80 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
USP21Q9UK80 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
USP21Q9UK80 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
USP21Q9UK80 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
USP21Q9UK80 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
USP21Q9UK80 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
USP21Q9UK80 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
USP21Q9UK80 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
USP21Q9UK80 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
USP21Q9UK80 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
USP21Q9UK80 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
USP21Q9UK80 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
USP21Q9UK80 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
USP21Q9UK80 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.22
USP21Q9UK80 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
USP21Q9UK80 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
USP21Q9UK80 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
USP21Q9UK80 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
USP21Q9UK80 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
USP21Q9UK80 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
USP21Q9UK80 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
USP21Q9UK80 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
USP21Q9UK80 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
USP21Q9UK80 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
USP21Q9UK80 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
USP21Q9UK80 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
USP21Q9UK80 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
USP21Q9UK80 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
USP21Q9UK80 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
USP21Q9UK80 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
USP21Q9UK80 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
USP21Q9UK80 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
USP21Q9UK80 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
USP21Q9UK80 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
USP21Q9UK80 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
USP21Q9UK80 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
USP21Q9UK80 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
USP21Q9UK80 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
USP21Q9UK80 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
USP21Q9UK80 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
USP21Q9UK80 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
USP21Q9UK80 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
USP21Q9UK80 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
USP21Q9UK80 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
USP21Q9UK80 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
USP21Q9UK80 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
USP21Q9UK80 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
USP21Q9UK80 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
USP21Q9UK80 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms