Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C3orf18Q9UK00 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C3orf18Q9UK00 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C3orf18Q9UK00 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C3orf18Q9UK00 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms