Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS51Q9UID3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS51Q9UID3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS51Q9UID3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS51Q9UID3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS51Q9UID3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS51Q9UID3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS51Q9UID3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS51Q9UID3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS51Q9UID3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS51Q9UID3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS51Q9UID3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS51Q9UID3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS51Q9UID3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VPS51Q9UID3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS51Q9UID3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS51Q9UID3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS51Q9UID3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms