Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV5

RAPGEFL1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEFL1Q9UHV5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAPGEFL1Q9UHV5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAPGEFL1Q9UHV5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAPGEFL1Q9UHV5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAPGEFL1Q9UHV5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RAPGEFL1Q9UHV5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAPGEFL1Q9UHV5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms